On dirait que tu as pris des mesures radicales! Si tu as vidé toutes les plantes et les débris organiques en décomposition et si tu as nettoyé ta serre à la javel tu as probablement éliminé une bonne partie des pathogènes et nuisibles. Les pucerons survivent à l'hiver abrités dans des adventices ou des plantes cultivées, sinon c'est sous forme d'oeufs, et là ils peuvent se cacher dans les débris végétaux - difficile de les éliminer.
L'idéal c'est la serre ventilée par temps très froid, ça nettoie tout. Sinon tu ne peux pas faire grand chose à part un bon nettoyage. Les oeufs et les spores de champignons peuvent survivre des mois, alors attendre un mois de plus à mon avis ne changera pas grand chose, à moins qu'on ait une vague de froid tardive

Avec tout ce que tu cultives dans ta serre tu vas réinstaller les nuisibles en remettant tes anciennes plantes et pots. A moins de tout renouveler, tu devras surveiller et contrôler les infestations dès leur réapparition. Les pulvérisations (bio ou pas) ne détruisent pas les oeufs et les spores, mais il y a toute une panoplie de traitements, tu trouveras ceux qui te conviennent.